Seminar Parallele Datenverarbeitung
Raum und Zeit
Die Veranstatung findet Montags von 14 bis 16 Uhr in D5-113 statt.
Inhalt
In dem Seminar werden Grundlagen der parallelen Datenverarbeitung vermittelt. Die Themenblcke
werden unten n�er beschrieben. Die Themenvergabe sowie die Diskussion ber weitergreifende Thematiken findet
in der ersten Vorlesungswoche statt.Das Seminar dient unter Anderem zur Vorbereitung eines Projekseminars
"Parallel Programming", welches im WS2003 stattfindet.
Falls vorab Fragen zu dem Seminar bestehen, schreibt einfach eine Email.
Themenblöcke
- Parallele Berechnungsmodelle/Parallele Programmierparadigmen
- Siddhartha Chatterjee, Parallel and Distributed Computing PRAM Algorithms
- David A. Bader, Using PRAM Algorithms on a Uniform-Memory-Access Shared-Memory Architecture
- Ian Foster, Designing and Building Parallel Programs
- Cluster Architekturen
- Amnon Barak, The MOSIX Multicomputer Operating System
- Amnon Barak, Scalable Cluster Computing with MOSIX for Linux
- Donald Becker, BEOWULF a parallel Workstation for Scientific Computing
- Thomas Sterling, A design Study for alternativ Network Topologies for Beowulf Parallel Workstation
- Jacek Radajewski, Beowulf HOWTO
- Thomas Sterling, Communication Overhead for Space Science Application on the Beowulf Parallel Workstation
- Message Passing and related
- V.S. Sunderam, PVM A Framework for Parallel Distributed Computing
- Al Geist, PVM Parallel Virtual Machine
- Jack Dongara, The Performance of PVM on MPP Systems
- G. A. Geist, PVM and MPI, A Comparison of Features
- Grid Computing
- Ian Foster, The Anatomy of the Grid
- Ian Foster, Wide-Area Implementation of the Message Passing Interface
- Ian Foster,Globus: A Metacomputing Infrastructure Toolkit
- Anwendungen in der Bioinformatik
- Oswaldo Trelles, On the Parallelization of Bioinformatic Applications
- Torbjrn Rognes, ParAlign: a parallel sequence alignment algorithm for rapid and sensitive database searches
- Leslie Grate, Sequence Analysis With the Kestrel SIMD Parallel Processor
- SGI Bioinformatics Performance Report
- Pedro Mendes, Simulation of biochemical and genetic networks HPC in the post-genome era
- Katerina Michalickova, Sequence Analysis on a 216-Processor Beowulf Cluster
Scheinkriterien
- Seminarvortrag max 45 Minuten
- Ausarbeitung 6-8 Seiten
Weiterführende Literatur
- Joseph Ja Ja, An Introduction to Parallel Algorithms Addison-Wesley, 1992
- Andrews, Foundations of Multithreaded, Parallel, and Distributed Programming Addison-Wesley, 2000
- Raber und Rnger, Parallele und verteilte Programmierung Springer, 2000
- Peter S. Pacheo, Parallel Programming with MPI Morgan Kaufmann, 1997
- Wenzel, Parallele Programmierkonzepte Franzis, 1991
- Tannenbaum, Verteilte Betriebssysteme Prentice Hall, 1994
- Vossen, Rechneraufbau und Rechnerstrukturen Oldenbourg, 1997
- F. Thomas Leighton, Einfhrung in Parallele Algorithmen und Architekturen Thomson Publishing, 1997
- John E. Hopcroft, Einfhrung in die Automatentheorie, Formale Sprachen ubd Komplexit�stheorie Addison-Wesley, 1997
- Rajkumar Buyya, High Performance Cluster Computing Prentice Hall, 1999