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| 392011 | | Molekulare Bioinformatik | | Hofestädt, Köhler |
| Seminar | | Di ab 14ct in C01-136 | | |
| | | In der Lehrveranstaltung wird ein allgemeiner Überblick über die molekulare Bioinformatik geschaffen (Datenbanken, Visualisierung, Sequenzanalyse). Verschiedene Methoden und Systeme der Bioinformatik werden anhand relevanter Literatur erarbeitet. Ein weiterer Schwerpunkt auf der Anwendung dieser Methoden, d.h. es werden vor allem Systeme vorgestellt die auch über das Internet verfügbar sind, so dass auch praktische Erfahrungen mit diesen Methoden gemacht werden können. |
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| 392014 | | Datenbankintegration für Molekularbiologische Datenbanken | | Hofestädt, Köhler |
| Seminar | | Di ab 14ct in C01-136 | | |
| | | Mehr als 400 Molekularbiologische Datenbanken sind weltweit verfügbar. Sie enthalten Daten zu Stoffwechselwegen, Proteinstrukturen, DNA Sequenzen, Organismen, Krankheiten, etc. Sie sind somit die Grundlage für viele bioinformatische und molekularbiologische Fragestellungen, für deren Bearbeitung häufig ein Durchsuchen und Kombinieren verschiedener Datenbanken erforderlich ist. Im Rahmen der Lehrveranstaltung werden einerseits spezifische Probleme der Integration molekularbiologischer Datenbanken und andererseits erschiedene Systeme für die Integration molekularbiologischer Datenbanken behandelt. Es wird ein aktueller Überblick über die verschiedenen molekularbiologischen Datenbanken, die Integrationsmöglichkeiten und den Mehrwert durch die Integration geschaffen. |
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| 392111 | | Datenbanken II | | Hofestädt |
| Vorlesung | | Do 12-14 Uhr | | 15.04.2002 - 19.07.2002 |
| | | Schwerpunkt der Vorlesung sind Konzepte der objektorientierten Datenbanken sowie die Integration von Dateisystemen und Datenbanken. Bezüglich der Datenbankintegration wird das Konzept der Föderierung genauer betrachtet |
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| 392112 | | Übungen zu Datenbanken II | | Freier, Niemann |
| Übung | | Do 12-14 Uhr in H1
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| 392118 | | Biomedizinische Wissensverarbeitung
| | Hofestädt |
| Vorlesung | | Mo 12:00-14:00 Uhr in C01-142 | | 15.04.2002 - 19.07.2002 |
| | | Eine Vielzahl von Krankheiten kann heute auf molekulare Defekte bis hin zur Punktmutation zurückgeführt werden. Die Verarbeitung dieser Daten im medizinischen Kontext ist eine aktuelle Aufgabe und steht in dieser Vorlesung zur Diskussion. Die Wissensverarbeitung spielt bei der Verarbeitung des unsicheren medizinischen Wissens eine herausragende Rolle. Kausal probabilistische Netze und Methoden aus dem Bereich Case Based Reasoning finden derzeit verstärkt Anwendung. |
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| 392119 | | Übungen zu Biomedizinische Wissensverarbeitung | | Köhler |
| Übung | |
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| 392136 | | Simulation metabolischer Netzwerke
| | Hofestädt |
| Seminar | | Do 14-16 Uhr in C01-249 | | |
| | | Metabolische Netzwerke können nur über geeignete Simulationstools analysiert werden. Das Seminar diskutiert verschiedenen Ansätze der Modellierung sowie die dazu verfügbaren Simulatoren |
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| 392141 | | Mediabolics - Hypermedia für metabolische Prozesse | | Lorenz, Köhler |
| Projekt-Seminar | | Mo 14-16 Uhr in D5-113
Mi 14-18 Uhr in D5-113 (Plenum)
Fr 10-12 Uhr in D5-113 | | |
| | | Das interdisziplinare Projektseminar orientiert sich im Hinblick auf Denkweise und Zielsetzung an realer industrieller Projektarbeit. Ziel ist es, die Seminar-TeilnehmerInnen mit heoretischen und vordergründig praktischen Aspekten des Software-Engineering-Prozesses vertraut zu machen. Ausgehend von einem konkreten Kundenszenario werden sämtliche konstruktiven Phasen und Tätigkeiten von der Vorstudie bis zur Auslieferung eines Produktes durchlaufen. Dabei sollen alle Aspekte eines realen Projekts behandelt werden, nicht nur der Entwurf und die Codierung von SW, sondern auch der Kontakt mit dem realen Kunden, die Erstellung eines Angebots, Brainstorming und Review, Aufwandsabschätzung und Planung, Literatursuche und Test, Spezifikation und Benutzerhandbuch, die Erhebung von Kennzahlen und nicht zuletzt der Umgang mit Risiken und Krisen, inkl. Projektleitung und Qualitätssicherung. Hinzu kommt die eigentliche Projektdokumentation (d.h. der zeitliche Verlauf, die Aufzeichnungen der im Projekt erhobenen Daten). Dabei sind u.a. unternehmerisches Handeln, Konzeptarbeit, Teamarbeit und Präsentationstechnik gefragt. Das wichtigste SW-Resultat des Projekts ist ein webbasiertes Hypermedia-Informations- und Lehrsystem, welches im Anschluss an das Projekt einen fester Bestandteil in der universitären Bioinformatik-Ausbildung darstellt. Um vorhandene Ressourcen wie Tutorials und WebSeiten automatisch in das System einzubinden und auf diese in geeigneter Art und Weise zu verweisen, soll eine auf speziellen Datenstrukturen und Methoden der KI basierende semantische Suchmaschine konzipiert und implementiert werden. Das Seminar hat eine Laufzeit von 12 Monaten und ist auf 15 Teilnehmer beschränkt. Es richtet sich an Studierende im NWI-Hauptstudium und an Studierende des Bachelor-Studiengangs Mediengestaltung. Voraussetzungen:
Voraussetzung ist die Bereitschaft, sich in eines oder mehrere der folgenden Themen einzuarbeiten:
Mediengestaltung, Hypermedia-Produktion und -Projektmanagement, Content-Management-/DB-Systeme (SQL), Bioinformatik, JAVA, HTML/XML, Dynamische Generierung von Webseiten, Methoden der KI und sonstige sich aus der Projektarbeit ergebenden Techniken. |
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| 392149 | | Arbeitsgemeinschaft Bioinformatik/ Medizinische Informatik | | |
| AG | | Mi in D5-113
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| | | Ausgewählte Themen der Bioinformatik |
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