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| 392119 | | Datenbanken I | | Hofestädt |
| Vorlesung | | Zeit: Mo 14-16 Uhr; Raum: H10 | | |
| | | Beginn: 26. April Inhalte der Vorlesung:
Relationen, Relationale Algebra, Konzeption einer Datenbank, ER-Modell, Realtionale Datenbanken, Architekturen von Datenbanken, Anfragesprachen, Architekturen verfügbarer "Molekularer Datenbanken".
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| | | Informationen zur Vorlesung |
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| 392120 | | Übungen zu 392011- Datenbanken I | | Freier |
| Übung | | 1: Zeit: Mi 10-12 Uhr; Raum: D5-113;
2: Zeit: Mi 15-17 Uhr; Raum: V2-222;
3: Zeit: Do 12-14 Uhr; Raum: U2-147; | | |
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Übung zu Veranstaltung 392119 (s. oben)
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| 392121 | | Biomedizinische Informationssysteme | | Hofestädt |
| Vorlesung | | Zeit: Di 14-16 Uhr; Raum: C01-226 | | |
| | | Beginn: 27. April
Eine Vielzahl von Krankheiten kann heute auf molekulare Defekte bis hin zur Punktmutation zurückgeführt werden. Die integrative Verarbeitung dieser Daten im medizinischen Kontext ist eine aktuelle Aufgabe und steht in dieser Vorlesung zur Diskussion. Die Wissensverarbeitung spielt bei der Verarbeitung des unsicheren biomedizinischen Wissens eine herausragende Rolle. Kausal probabilistische Netze und Methoden aus dem Bereich Case Based Reasoning finden derzeit verstärkt Anwendung.
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| 392122 | | Übungen zu 392121 - Biomedizinische Informationssysteme | | Rüegg |
| Vorlesung | | 1. Termin: Do 16-18 Uhr; Raum: D5-113 | | |
| | | Beginn: 29. April
Übung zu Veranstaltung 392121 (s. oben)
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394001 | | Sequenzanalysepraktikum | | Lorenz |
| Praktikum | | Zeit: Do 10-12 Uhr; Raum: V2-221 (Rechnerpool) | | |
| | | Zu den täglichen Aufgaben der Molekularen Biologie und Bioinformatik gehört die Benutzung einer wachsenden Anzahl von Software-Werkzeugen, die das Internet zur Verfügung stellt. Dazu gehört der Zugriff auf die großen Datenbanken (GenBank, EMBL, etc.), "Suche nach Homologen Sequenzen", "Vergleich von Sequenzfamilien" und "Bestimmung von Sekundär- und Tertiärstrukturen". Anhand biologisch motivierter Aufgabenstellungen werden Erfahrungen im Umgang mit diesen Werkzeugen vermittelt.
Die Veranstaltung richtet sich an Studierende im Hauptstudium NWI/Biotechnologie und Studierende des B. Sc. Bioinformatik und Genomforschung im vierten Semester.
Interessenten tragen sich in die entsprechende Teilnehmerliste ein (Raum D5-116).
Die Übung setzt Vorkenntnisse aus den Vorlesungen „Molekulare Genetik I und II" und „Grundlagen der Sequenzanalyse“ voraus. Diese können auch parallel zur Übung, z.B. anhand des Skriptes „Grundlagen der Sequenzanalyse“ von S. Kurtz erworben werden. |
| | | More Information |
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| 392016 | | Parallele Datenverarbeitung | | Niemann |
| Seminar | | Zeit: Di 14-16 Uhr Raum: D5-113 | | |
| | | In dem Seminar "Parallele Datenverarbeitung" werden theoretische sowie praktische Kenntnisse
Im Bereich High Performance Computing vermittelt. Eine ausführliche Themenliste findet man
unter www.techfak.uni-bielefeld.de/~mniemann
Die Vorbesprechung findet in der ersten Semesterwoche statt. (Siehe Aushang -- Ankündigung auf der Website) Weiterführende Literatur:
Joseph Ja Ja, An Introduction to Parallel Algorithms Addison-Wesley, 1992
Andrews, Foundations of Multithreaded, Parallel, and Distributed ProgrammingAddison-Wesley, 2000
Raber und Rünger, Parallele und verteilte Programmierung, Springer, 2000
Peter S. Pacheo, Parallel Programming with MPI, Morgan Kaufmann, 1997
Wenzel, Parallele Programmierkonzepte, Franzis, 1991
Tannenbaum, Verteilte Betriebssysteme, Prentice Hall, 1994
Vossen, Rechneraufbau und Rechnerstrukturen Oldenbourg, 1997
F. Thomas Leighton, Einführung in Parallele Algorithmen und Architekturen, Thomson Publishing, 1997
John E. Hopcroft, Einführung in die Automatentheorie, Formale Sprachen ubd Komplexit?ätstheorie, Addison-Wesley, 1997
Rajkumar Buyya, High Performance Cluster Computing, Prentice Hall, 1999 |
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| 392153 | | Mediabolics III | | Lorenz |
| Projekt | | Zeit: Do 14-17 Uhr; Raum: D5-116 | | |
| | | Die Lehrveranstaltung läuft seit dem WiSe 03/04. Es werden keine neuen Teilnehmer aufgenommen.
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| 392130 | | Petrinetze in der biologischen Anwendung | | Hofestädt |
| Seminar | | Zeit: Do 14-16 Uhr; Raum: D5-113 | | |
| | | Nebenläufige Prozesse lassen sich geeignet durch den von Adam Petri entwickelten Formalismus modellieren und simulieren. Im Seminar werden einfache Petrinetze definiert und spezifische Erweiterungen dieser Theorie bis hin zu aktuellen Simulatoren diskutiert.
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| 392131 | | Integration biologischer Datenbanken | | Köhler, Freier |
| Seminar | | Zeit: Blockseminar, Termine nach Vereinbarung | | |
| | | Mehr als 400 Molekularbiologische Datenbanken sind weltweit verfügbar.
Sie enthalten Daten zu Stoffwechselwegen, Proteinstrukturen, DNA
Sequenzen, Organismen, Krankheiten, etc. Sie sind somit die Grundlage
für viele bioinformatische und molekularbiologische Fragestellungen,
für deren Bearbeitung häufig ein Durchsuchen und Kombinieren
verschiedener Datenbanken erforderlich ist. Im Rahmen der
Lehrveranstaltung werden einerseits spezifische Probleme der Integration
molekularbiologischer Datenbanken und andererseits verschiedene Systeme
für die Integration molekularbiologischer Datenbanken behandelt. Es wird
ein aktueller Überblick über die verschiedenen molekularbiologischen
Datenbanken, die Integrationsmöglichkeiten und den Mehrwert durch die
Integration geschaffen.
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| 392132 | | Biomedizinische Informationssysteme | | Hofestädt, Schneider |
| Seminar | | Zeit: Di 14-16 Uhr; Raum: D5-113 | | |
| | | In diesem Seminar werden aktuelle Ansätze im Bereich der Entwicklung und Implementierung von komplexen Laborinformationssystemen diskutiert.
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392185
Seminar | | Arbeitsgemeinschaft Bioinformatik
Zeit: n.V. ; Ort: D5-113 | | Hofestädt, Lorenz |
| | | Ausgewählte Themen der Bioinformatik
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