Medizinische Bioinformatik
und Systembiologie




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Teaching in SoSe 2006


392018 Datenbanken I Hofest�dt
Vorlesung Zeit: Di, 14 - 16 Uhr; Raum: H3  
  In der Vorlesung werden die folgenden Schwerpunkte abgehandelt: Datenbankentwicklung, Relationen, ER-Modellierung, relationale Datenbanken, Methoden der Datenbankintegration, Data Warehousing, f�derierte Datenbanken und deduktive Datenbanken.

 
392019 �bungen zu 392018 - Datenbanken I Prins
�bung Zeit: Mi, 8 - 10 Uhr / 12 - 14 Uhr / 16 - 18 Uhr; Raum: C0-259   
  Vertiefung der Inhalte der Vorlesung anhand von �bungsaufgaben.
Themen: Relationen, Relationale Algebra, Konzeption einer Datenbank, ER-Modell, Relationale Datenbanken, Architekturen von Datenbanken, Anfragesprachen, Architekturen verf�gbarer "Molekularer Datenbanken"
zus�tzlich: Relationale Datenbanksoftware, Entwurfswerkzeuge, Applikationsentwicklung

 
392137 Web-basierte Informationssysteme in der molekularen Bioinformatik T�pel
Vorlesung Zeit: Do, 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113  
  Zun�chst erfolgt die Definition und Diskussion des klassischen Begriffs der Informationsverarbeitung, der Informationssysteme und Datenbanksysteme. Au�erdem werden in diesem Zusammenhang biomedizinische Ontologien und Austauschformate vorgestellt und an praktischen Beispielen vertieft. Auf dieser Grundlage werden nun relevante Datenquellen im Bereich der Biomedizin vorgestellt. Im Anschlu� erfolgt die Vorstellung von Integrationsans�tzen und existierender Integrationstools zur Integration heterogener Datenquellen. Mit einer Einf�hrung in die verschiedenen Techniken zur Entwicklung von Web-Applikationen wird die Veranstaltung abgeschlossen.

 
392138 �bungen zu 392138 - Web-basierte IS in der molekularen Bioinformatik T�pel
�bung Zeit: Do, 16 - 18 Uhr; Raum: D5-113  
  Es werden die Themen der Vorlesung anhand von theoretischen und praktischen �bungsaufgaben vertieft. (�bung zu Veranstaltung 392137)

 
392142Medizinische Wissensverarbeitung Hofest�dt
Vorlesung Zeit: Mo, 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113  
  Die medizinische Wissensverarbeitung ist ein wesentliches Gebiet der �Medizinischen Informatik�. Die molekulare Biologie in Kombination mit den Methoden der Bioinformatik hat auch dieses Gebiet in den vergangenen Jahren neu pr�gen k�nnen. Der diagnostische Einsatz der Methoden des fallbasierten Schlie�ens (Case Based Reasoning) sowie der kausal probabilistischen Netze werden in dieser Vorlesung zentral behandelt.

 
392143 �bungen zu 392142 - Medizinische Wissensverarbeitung Prins
�bung Zeit: Mo, 16 - 18 Uhr; Raum: D5-113  
  Es werden die Themen der Vorlesung anhand von �bungsaufgaben vertieft. Dabei werden diverse Ans�tze zur Wissensverareitung innerhalb von medizinischen Kontexten besprochen. Grundlegend dabei ist der Einsatz von Database-Management-Systemen und die Integration der ben�tigten Daten.

 
392139 Parallele Datenverarbeitung Niemann
Seminar Zeit: NN, Raum: NN 
  

 
392140 Parallele Programmierung Niemann
Projekt Zeit: NN; Raum: NN  
   
 
392135 Modeling and Simulation of Signal Pathways Hofest�dt, Hariharaputran
Seminar Zeit: NN, Raum: D5-113 
  Vorbesprechung am Dienstag, 11. April 2006, 12 Uhr s.t. in D5-113

 
392136 Seminar Bioinformatik Hofest�dt
Seminar Zeit: NN, Raum: D5-113 
  Vorbesprechung am Montag, 10. April 2006, 12 Uhr s.t. in D5-113

 
392162 Integration und Analyse von Signaling Pathways T�pel, Hariharaputran
Projekt Zeit: Mi, 17 Uhr; Raum: D5-113 
  Im Rahmen dieser Veranstaltung soll ein Werkzeug entwickelt werden, das Signaling Pathways auf der Basis der Struktur der beteiligten Proteine vergleicht. Dazu sind relevante Informationen aus molekularbiologischen Datenquellen zu integrieren und geeignete Algorithmen f�r die Analyse zu implementieren. Auf dieser Basis wird eine webbasierte GUI entwickelt, die den Zugriff auf die Anwendungslogik erm�glicht und so z.B. die Analyseresultate visualisiert.

 
392141 Wissenschaftliches Arbeiten Hofest�dt
Seminar Zeit: Do, 11 Uhr; Raum: D5-113 
  Vorbesprechung am Donnerstag, 13. April 2006, 11 Uhr s.t.  in D5-113

 
392180
Seminar
 Arbeitsgemeinschaft Bioinformatik
Zeit: Do, 11 Uhr ; Raum: D5-113
 Hofest�dt
  Ausgew�hlte Themen der Bioinformatik