Medizinische Bioinformatik
und Systembiologie




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Teaching in SoSe 2007


392139   Biomedizinische Informationssysteme   Hofestädt
Vorlesung   Zeit: Do., 10 - 12 Uhr; Raum: D5-113    
   

Eine Vielzahl von Krankheiten kann heute auf molekulare Defekte bis hin zur Punktmutation zurückgeführt werden. Die integrative Verarbeitung dieser Daten im medizinischen Kontext ist eine aktuelle Aufgabe und steht in dieser Vorlesung zur Diskussion. Die Wissensverarbeitung spielt bei der Verarbeitung des unsicheren biomedizinischen Wissens eine herausragende Rolle. Kausal probabilistische Netze und Methoden aus dem Bereich Case-Based Reasoning finden derzeit verstärkt Anwendung.

 

  Informationen zur Vorlesung
392140   Übungen zu 392139 - Biomedizinische Informationssysteme   Kormeier
Übung   Zeit: Do., 09 Uhr; Raum: D5-113     
   

Es werden die Themen der Vorlesung anhand von theoretischen und praktischen Übungsaufgaben vertieft.

 

  Informationen zur Übung
392144   Medizinische Wissensverarbeitung   Hofestädt
Vorlesung   Zeit: Mi., 12 - 14 Uhr; Raum: D5-113    
   

Die medizinische Wissensverarbeitung ist ein wesentliches Gebiet der �Medizinischen Informatik�. Die molekulare Biologie in Kombination mit den Methoden der Bioinformatik hat auch dieses Gebiet in den vergangenen Jahren neu prägen können. Der diagnostische Einsatz der Methoden des fallbasierten Schließens (Case Based Reasoning) sowie der kausal probabilistischen Netze werden in dieser Vorlesung zentral behandelt.

 

    Informationen zur Vorlesung
392145   Übungen zu 392144 - Medizinische Wissensverarbeitung   Kormeier
Übung   Zeit: Do. 09 Uhr; Raum: D5-113    
    Es werden die Themen der Vorlesung anhand von theoretischen und praktischen Übungsaufgaben vertieft.

  Informationen zur Übung
392147 Datenbanken II   Töpel
Vorlesung   Zeit: Do., 14 - 16 Uhr; Raum: H15    
   

Das Modul erweitert und vertieft Architekturprinzipien, Datenstrukturen und Algorithmen von Datenbanksystemen. Dazu werden insbesondere die folgenden Themengebiete behandelt: Modelle und Algorithmen der Transaktionsverwaltung, Anfragebearbeitung und �optimierung, Recovery, föderierte Datenbanken und Data Warehousing sowie erweiterte Datenmodelle. 

 

    Informationen zur Vorlesung
392148   Übungen zu 392147 - Datenbanken II   Töpel
Übung   Zeit: Di., 8 - 10, 10 - 12. 12 - 14 Uhr; Raum: C0-259    
    Es werden die Themen der Vorlesung anhand von theoretischen und praktischen Übungsaufgaben vertieft.

    Informationen zur Übung
392149   CELLmicrocosmos 3: Zelleditor   Hofestädt, Sommer
Projekt   Zeit: NN, Raum: C5-151  
    Dieses Projekt wird sich mit der Realisation eines Zelleditors befassen. Dieser soll in der Lage sein, verschiedene Zelltypen (z.B. Hapatozyten, Pflanzenzellen) mit ihren unterschiedlichen Zellkomponenten (z.B. Nuclei, Mitochondrien, Golgi-Apparat) drei-dimensional modellieren zu können. Für die wichtigsten Komponenten stehen bereits 3D-Modelle zur Verfügung, weitere werden folgen. Ein modularer, erweiterungsfähiger Aufbau wird somit unabdingbar sein. Desweiteren sollen die Ergebnisse aus den CELLmicrocosmos 2.0/2.1 Projekt integriert werden, wobei es sich um Membran-Modelle handelt. Das Resultat wird nicht eine 100% realistische Zelle sein (können), aber ein optisch und schematisch auch für biologische Zwecke sinnvoll einsetzbares Zellmodell. Die Visualisierung und Navigation durch dieses 3D-Modell soll anschließend mit Hilfe unseres Labor-Equipments erfolgen.
Vorbesprechung: Mittwoch, den 11.04.2007, 14:00 Uhr

    Informationen zum Projekt
392150   Entwicklung einer flexiblen Nutzerschnittstelle für relationale DBS   Töpel, Kormeier
Projekt   Zeit: Mi., 16 Uhr; Raum: D5-113  
    Im Rahmen der Veranstaltung soll eine flexible, web-basierte, grafische Nutzerschnittstelle für relationale Datenbanksysteme entworfen und implementiert werden. Als Grundlage der Umsetzung sollen Apache Tomcat, JSP und AJAX dienen. Somit sind natürlich entsprechende Kenntnisse in Java und SQL von Vorteil.
Vorbesprechung: Mittwoch, den 04.04.2007, 17:00 Uhr

   
392143   Parallele Datenverarbeitung   Niemann
Projekt   Zeit: NN, Raum: D5-113  
   

 

 

   
392146   Seminar Bioinformatik   Hofestädt
Seminar   Zeit: NN, Raum: D5-113  
   

Im Rahmen dieser Veranstaltungen werden aktuelle Themen der Bioinformatik recherchiert, präsentiert und diskutiert.
Vorbesprechung: Dienstag, den 17.04.2007, 12:00 Uhr

    More Information
392183
Seminar
  Arbeitsgemeinschaft Bioinformatik
Zeit: Di, 11 Uhr ; Raum: D5-113
  Hofestädt
    Ausgewählte Themen der Bioinformatik, Vorträge von Diplomanden und Masterstudenten
  

    Informationen zum Seminar