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Teaching in SoSe 2012


392187
Seminar
  AG Seminar Bioinformatik / Medizinische Informatik
Zeit: Do, 11 Uhr ; Raum: D5-113
  Hofestädt
    Ausgewählte Themen der Bioinformatik

    Weitere Informationen
392119 Biomedizinische Informationssysteme    
Vorlesung   Zeit: Mi, 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113;   Hofestädt
392120        
Übung   Zeit: n.V.; Raum: D5-113   Shoshi
    Zunächst erfolgt die Definition und Diskussion des klassischen Begriffs der Informationsverarbeitung und der Informationssysteme. Außerdem werden grundlegende Bemerkungen zu Ontologien und Datenaustauschformaten gemacht, sowie relevante Beispiele aus der Praxis vorgestellt. Im Anschluß erfolgt eine Einführung in die typischen Datenquellen im Bereich der molekularen Medizin. Auf der Grundlage unterschiedlicher Integrationsansätze werden existierende Werkzeuge zur Integration heterogener Datenquellen diskutiert. Abschließend wird eine Einführung in die grundlegenden Techniken zur Entwicklung web-basierter Informationssysteme gegeben.

Mit theoretischen und praktischen Übungen werden die Themen der Vorlesung vertieft.

    Weitere Informationen
392147   Fehleranalyse bei molekularen Datenbanken   Hofestädt
Seminar   Zeit: n.V.; Raum: D5-113  
    1. Vorbesprechung: Mi, 04.04.2012, 11 Uhr s.t.; Raum D5-113
2. Vorbesprechung: Mi, 11.04.2012, 11 Uhr s.t.; Raum D5-113
    Weitere Informationen
392153   Konzeption und Implementierung biomedizinischer Informationssysteme   Hofestädt, Shoshi
Projekt   Zeit: nach Absprache mit den Teilnehmern; Raum: D5-113  
    1. Vorbesprechung: Mi, 04.04.2012, 12 Uhr s.t.; Raum D5-113
2. Vorbesprechung: Mi, 11.04.2012, 12 Uhr s.t.; Raum D5-113
    Weitere Informationen
392105   Medizinische Wissensverarbeitung    
Vorlesung   Zeit: Di, 14 - 16 Uhr; Raum: T2-214   Hofestädt
392106        
Übung   Zeit: n.V.; Raum: D5-113   Braun
    Die medizinische Wissensverarbeitung ist ein wesentliches Gebiet der „Medizinischen Informatik“. Die molekulare Biologie in Kombination mit den Methoden der Bioinformatik hat auch dieses Gebiet in den vergangenen Jahren neu prägen können. Der diagnostische Einsatz der Methoden des fallbasierten Schließens (Case Based Reasoning) sowie der kausal probabilistischen Netze werden in dieser Vorlesung zentral behandelt.

Es werden die Themen der Vorlesung anhand von theoretischen und praktischen Übungsaufgaben vertieft.

    Weitere Informationen
392151   Projekt Bioinformatik   Giegerich, Hofestädt, Stoye
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: n.V.  
   

    Weitere Informationen
392250   Analyse und Visualisierung biologischer Netzwerke   Kormeier
Projekt (Master)   Zeit: n.V.; Raum: D-113  
   

    Weitere Informationen
392159 Datenbanken II    
Vorlesung   Zeit: Do, 14 - 16 Uhr; Raum: S2-137;   Kormeier
392160        
Übung   Zeit: Di, 12-14; Raum: V0-133   Kormeier
   

Das Modul erweitert und vertieft Datenstrukturen, Algorithmen und Architekturprinzipien von Datenbanksystemen. Dazu werden insbesondere die folgenden Themengebiete behandelt:

  • Physikalische Datenspeicherung (Filestruktur, Indices, Hashing etc.)
  • Anfragebearbeitung und –optimierung
  • Transaktionsmanagement
  • Recovery und Concurrency Control
  • Verteilte und Föderierte Datenbanken
  • Data Mining und Data Warehouses
  • Schema- und Datenintegration
  • Anwendungen (Bioinformatik, Semantic Web, Multimedia, Geographische Datenbanken)

Kompetenzen
Die Vorlesung vermittelt ein tieferes Verständnis von Datenbanksystemen, ihrem Aufbau, Implementierung und Anwendungen. Die Vorlesung vermittelt ebenfalls Grundlagen zu Techniken des Data Mining und der Datenintegration. Die Behandlung von konkreten Datenbankanwendungen in den Bereichen Semantic Web, Bioinformatik und Multimedia rundet die Vorlesung ab und liefert praxisrelevante Kenntnisse. Die erworbenen Kenntnisse sollen die Studierenden zur (Weiter-) Entwicklung von Datenbanksystemen sowie zur Realisierung nicht-trivialer Datenbankanwendungen befähigen.

    Weitere Informationen
392171   Message Passing Programming   Braun
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: C5-153    
   

Vorbesprechung: 04.04.2012; 14 s.t.; D5-113

In dem Projekt werden Lösungen zu aktuellen Problematiken im Bereich der Programmierung von Message Passing Systemen erarbeitet, die an AG internen Projekten anknüpfen. Weitere Informationen bzw. die detaillierte Vorstellung der Thematiken erfolgt beim ersten Treffen.

    Weitere Informationen
392232   Cell Visualization   Sommer
Seminar   Zeit: 10 c.t.; Raum: D5-113 oder C5-151  
   

In allen Biologie-verwandten Studienfächern begegnen uns die unterschiedlichsten Visualisierungsansätze von Zellen: Angefangen von Buch-Illustrationen über Filme/Animationen, verschiedenste Arten der Mikroskopie, Lernsoftware und Membransimulationen. In diesem Seminar soll im Rahmen von Referaten ein Überblick und ein erstes Bewertungskonzept zu diesem weitläufigen Thema erarbeitet werden.

Vorbesprechung: 04.04.2012, 10.00 c.t., Raum: D5-113

    Weitere Informationen
392170   CELLmicrocosmos Cell Modelling   Sommer
Projekt   Zeit: 14 c.t.; Raum: C5-151  
   

Das CELLmicrocosmos 1 Projekt beschäftigt sich mit der drei-dimensionalen Modellierung von Zellen, während sich das CELLmicrocosmos 2 Projekt mit der Modellierung und Simulation von Membranen beschäftigt. Sowohl programmiertechnische, datenintegrative als auch 3D-modellierende Aufgabenstellungen sind hier möglich.

Vorbesprechung: 04.04.2012, 14.00 c.t., Raum: C5-151

    Weitere Informationen
392110   Interdisziplinäre ZellVisualisierung !NEU!   Sommer
Vorlesung   Zeit: 10 c.t.; Raum: D5-113 oder C5-151  
   

In der Vorlesung werden die unterschiedlichsten ZellVisualisierungsansätze besprochen und analysiert. Gleichzeitig wird Basiswissen im Bereich der Zellbiologie vermittelt werden. Das interdisziplinäre Spektrum reicht von Filmsequenzen über Buch-Illustrationen, Webseiten, Datenbanken, Edukativen Ansätzen, Computerspielen und -programmen. In Relation dazu werden zelluläre Simulationsansätze, wissenschaftliche Publikationen und die durch die Mikroskopie generierte Realität gesetzt.

Vorbesprechung: 04.04.2012, 10.00 c.t., Raum: D5-113

    Weitere Informationen
         
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