Teaching in SoSe 2013
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| 392187 Seminar |
AG Seminar Bioinformatik / Medizinische Informatik Zeit: Do, 11 - 13 Uhr ; Raum: D5-113 |
Hofestädt | ||
| Ausgewählte Themen der Bioinformatik | ||||
| Weitere Informationen | ||||
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| 392119 | Biomedizinische Informationssysteme | |||
| Vorlesung | Zeit: Mi, 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113; | Hofestädt | ||
| 392120 | ||||
| Übung | Zeit: nach Absprache mit den Teilnehmern; Raum: D5-113 | Shoshi | ||
| Zunächst erfolgt die Definition und Diskussion des klassischen
Begriffs der Informationsverarbeitung und der Informationssysteme. Außerdem
werden grundlegende Bemerkungen zu Ontologien und Datenaustauschformaten
gemacht, sowie relevante Beispiele aus der Praxis vorgestellt. Im Anschluß
erfolgt eine Einführung in die typischen Datenquellen im Bereich
der molekularen Medizin. Auf der Grundlage unterschiedlicher Integrationsansätze
werden existierende Werkzeuge zur Integration heterogener Datenquellen
diskutiert. Abschließend wird eine Einführung in die grundlegenden
Techniken zur Entwicklung web-basierter Informationssysteme gegeben.
Mit theoretischen und praktischen Übungen werden die Themen der Vorlesung vertieft. | ||||
| Folien zur Vorlesung/Übungszettel | ||||
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| 392147 | Fehleranalyse bei molekularen Datenbanken | Hofestädt | ||
| Projekt/Projektseminar | Zeit: n.V.; Raum: D5-113 | |||
| Weitere Informationen | ||||
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| 392150 | Konzeption und Implementierung biomedizinischer Informationssysteme | Hofestädt, Shoshi | ||
| Projektseminar | Zeit: nach Absprache mit den Teilnehmern; Raum: D5-113 | |||
| Weitere Informationen | ||||
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| 392105 | Medizinische Wissensverarbeitung | |||
| Vorlesung | Zeit: Di, 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113 | Hofestädt | ||
| 392106 | ||||
| Übung | Zeit: n.V.; Raum: D5-113 | Lewinski | ||
| Die medizinische Wissensverarbeitung ist ein wesentliches Gebiet der „Medizinischen Informatik“. Die molekulare Biologie in Kombination mit den Methoden der Bioinformatik hat auch dieses Gebiet in den vergangenen Jahren neu prägen können. Der diagnostische Einsatz der Methoden des fallbasierten Schließens (Case Based Reasoning) sowie der kausal probabilistischen Netze werden in dieser Vorlesung zentral behandelt. Es werden die Themen der Vorlesung anhand von theoretischen und praktischen Übungsaufgaben vertieft. | ||||
| Folien zur Vorlesung/Übungszettel | ||||
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| 392250 | Analyse und Visualisierung biologischer Netzwerke | Kormeier | ||
| Projekt (Master) | Zeit: Do 16 - 18; Raum: D5-113 | |||
| Vorbesprechung: Do., 12.04.2013, 16 Uhr s.t.; D5-113 | ||||
| Weitere Informationen | ||||
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| 392159 | Entwicklung eines web-basierten Informationssystems für molekularbiologische Daten | Kormeier | ||
| Projekt | Zeit: Mi 16 - 18; Raum: D5-113 | |||
| Vorbesprechung: Mi., 11.04.2013, 16 Uhr s.t.; D5-113 | ||||
| Weitere Informationen | ||||
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| 392171 | Message Passing Programming | Lewinski | ||
| Projekt | Zeit: n.V.; Raum: C5-153 | |||
1. Vorbesprechung: Do., 18.04.2013; 14 s.t.; D5-113 | ||||
| Weitere Informationen | ||||
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| 392232 | Cell Visualization | Sommer | ||
| Seminar | Zeit: Mi., 10 c.t.; Raum: D5-113 oder C5-151 | |||
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In allen Biologie-verwandten Studienfächern begegnen uns die unterschiedlichsten Visualisierungsansätze von Zellen: Angefangen von Buch-Illustrationen über Filme/Animationen, verschiedenste Arten der Mikroskopie, Lernsoftware und Membransimulationen. In diesem Seminar soll im Rahmen von Referaten ein Überblick und ein erstes Bewertungskonzept zu diesem weitläufigen Thema erarbeitet werden. Vorbesprechung: Mi., 10.04.2013, 10.00 c.t., Raum: D5-113 | ||||
| Weitere Informationen | ||||
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| 392170 | CELLmicrocosmos Cell Modelling: | Sommer | ||
| Projekt | Zeit: Mi., 14 c.t.; Raum: C5-151 | |||
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Das CELLmicrocosmos 1 Projekt beschäftigt sich mit der drei-dimensionalen Modellierung von Zellen, während sich das CELLmicrocosmos 2 Projekt mit der Modellierung und Simulation von Membranen widmet. Sowohl programmiertechnische, datenintegrative als auch 3D-modellierende Aufgabenstellungen sind hier möglich. Dieses Semester wird der Fokus auf möglichst realistischer stereoskopischer Animation liegen, wobei unsere PowerWall zum Einsatz kommen wird. Vorbesprechung: Mi., 10.04.2013, 14.00 c.t., Raum: C5-151 | ||||
| Weitere Informationen | ||||
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| 392110 | Interdisziplinäre ZellVisualisierung | Sommer | ||
| Vorlesung | Zeit: Fr., 10 c.t.; Raum: D5-113 oder C5-151 | |||
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In der Vorlesung werden die unterschiedlichsten ZellVisualisierungsansätze besprochen und analysiert. Gleichzeitig wird Basiswissen im Bereich der Zellbiologie vermittelt werden. Das interdisziplinäre Spektrum reicht von Filmsequenzen über Buch-Illustrationen, Webseiten, Datenbanken, Edukativen Ansätzen, Computerspielen und -programmen. In Relation dazu werden zelluläre Simulationsansätze, wissenschaftliche Publikationen und die durch die Mikroskopie generierte Realität gesetzt. Nicht zuletzt wird dabei auch auf die umfangreichen Resultate aus den letzten CELLmicrocosmos-Projekten und -Abschlussarbeiten zurückgegriffen werden können. Vorbesprechung: Mi., 10.04.2013, 10.00 c.t., Raum: D5-113 | ||||
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