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Lectures in WiSe 05/06 at the Bioinformatics / Medical Informatics Department

 
392149 Parallele Algorithmen Niemann
Vorlesung Zeit: Do, 14 - 16 Uhr; Raum: V2-200  
  Ausgangspunkt ist die Definition paralleler Algorithmen. Grundlegende theoretische Modelle der parallelen Datenverarbeitung werden vorgestellt (z.B. Schaltkreise, P-RAM). Der Entwurf paralleler Algorithmen wird diskutiert. Grundkonzepte parallele Architekturen werden vorgestellt.

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392150 Übungen zu 392149 - Parallele Algorithmen Niemann
Übung Zeit: NN; Raum: NN  
  Parallele Algorithmen auf der Grundlage des "message passing" Konzeptes werden in der Übung am verfügbaren Parallelrechner implementiert und getestet.

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392164 Modellierung und Simulation metabolischer Netzwerke Töpel
Vorlesung Zeit: Di, 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113  
  Die Vorlesung gibt einen Überblick über die existierenden Modellansätze zur Modellierung metabolischer Netzwerke. Insbesondere wird die regelbasierte Modellierung sowie die Modellierung mit Petrinetzen vorgestellt. Anschließend erfolgt eine Überblick über die verfügbaren Datenquellen im Internet sowie die verfügbaren Simulatoren.

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392165 Übungen zu 392164 - Modellierung und Simulation metabolischer Netzwerke Prins
Übung Zeit: n.V.; Raum: D5-113  
  In dieser Übung werden verschiedene Themen aus der Vorlesung vertieft behandelt und praktisch nachvollzogen. Schwerpunkte der Übung sind: Design molekularer Datenbanken, dynamische Modellierung von Pathways und Datenvisualisierung.

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392167 Analyse und Simulation - Tools for Bioinformatics Niemann, Prins
Projekt Zeit: Mo. 14:00 c.t.; Raum: C5-153  
  

Ziel des Projekts ist es eine Bioinformatics-Workbench aufzubauen.

Es soll dabei eine Linux-Live-CD entwickelt werden, die nahezu alle relevanten (frei erhältlichen) Softwarewerkzeuge für Bioinformatiker und Biotechnologen bereitstellt. Sie soll nach Fertigstellung  in Forschung und Lehre eingesetzt werden.

Besonderes Augenmerk wird auf hohe Kompatibilität und Performanz des Gesamtsystems gelegt.

Die Grundlage sollen daher sogenannte Mini-Distros bilden, wie z.B. Feather-Linux, Damn-Small-Linux oder Morphix, etc.

Ergebnisse

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392166 Analyse metabolischer Netzwerke Töpel
Seminar Zeit: Di, 16 - 18 Uhr; Raum: D5-113 
  Im Seminar wird grundlegende und weiterführende Literatur zum Thema "Metabolische Netzwerke" behandelt. Zu den entsprechenden Themen werden durch die Teilnehmer Vorträge gehalten.

  Informationen zum Seminar
392188
Seminar
 Arbeitsgemeinschaft Bioinformatik
Zeit: Do, 13 - 14 Uhr; Ort: D5-113
 Töpel
  Ausgewählte Themen der Bioinformatik

  Informationen zum Seminar
     
 

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