Research Projects

• MoRitS: Modellbasierte Realisierung intelligenter Systeme in der Nano- und Bio-Technologie
• BMBF Project: Development of algorithms for bioinformatics analysis of complex metabolic and molecular-genetics networks
• BMBF Project: Deutsch/Russisches Forschungs-Netzwerk: Integrative Analyse komplexer metabolischer Netzwerke
• DAAD Project: Leonhard-Euler-Programm
• BMBF Project: "Semi-automatic construction and visualization of complex metabolic networks based on the Petri net Concept"
• BMBF Project: "Prediction and reconstruction of metabolic networks based on textmining methods"
  
• German/Russian Virtual Network of Bioinformatics
  Computational Systems Biology (New Homepage) (Old Homepage)
  Flyer available in English or in German
• DAAD PPP German-Norwegian Collaborative Research Support Scheme
  Project "Modelling and simulation of Quorum Sensing in 3-dimensional space in V. salmonicida" (2007-2008)
  
• EU FP6
  CardioWorkBench: Drug Design for Cardiovascular Diseases - Integration of In Silico and In Vitro Analysis
• BMBF Joint Research Project
  CELLECT: Databases and data integration
• DFG-Forschergruppe Informationsfusion: Werkzeug zur Integration von Methoden und Daten zur DNA-Sequenzanalyse -Workbench für die Informationsfusion
• DFG-Schwerpunkt: Informatikmethoden zur Analyse und Interpretation großer genomischer Datenmengen: "Modellierung und Animation regulatorischer Genwirknetze (MARG)"
• BMBF Deutsches Humangenomprojekt (DHGP): "Integrative Simulation of Gene Controlled Biochemical Networks"
• Expertensystem D3-IEM - Unterstützung bei Untersuchungsanforderung, Diagnose und Therapie
  
• Visualisierung und Animation Metabolischer Prozesse
• HIEMIS - Human Inborn Errors of Metabolism Information System - Wissensrepräsentation im Internet
• Kooperation mit dem Fraunhofer-Institut für Aerosol und Toxikologieforschung in Hannover
• Stifterverband für die Deutsche Wissenschaft (Kurt-Eberhard-Bode Stiftung):
  • Computerunterstützte Diagnose von Stoffwechselerkrankungen
  • Entwicklung eines Konzeptes zur Informationsfusion zum Wirkstoff-Pointing von Stoffwechselerkrankungen
• Landesprojekt des Landes Sachsen-Anhalt: Molekularer Wissensserver der Genregulation
  
• VW-Stiftung: Modellierung und Simulation der Genregulation
  
• Knowledge Discovery zur Sequenzanalyse - Ali Baba
  
• Entwurf und Implementierung eines Informationssystems zur Verwaltung molekularbiologischer Simulationsdaten (MEKDB)
  
• Entwicklung eines Wissensservers für die innere Medizin
  
• BMBF-Förderinitiative Notebook University im Programm "Neue Medien in der Bildung"

General Research Topics

• Development of databases and database integration
• Information systems for metabolic diseases
• Biological paradigms of computability
• Conceptual datastructures for semantic database integration
• Modeling and simulation of metabolic processes
• Parallel computing for sequence analysis
• Multimedia implementation of virtual scenarios
• Bio-Medical knowledge processing