Am Lehrstuhl für Fermentationstechnik wurde ein Verfahren zur Untersuchung der Homogenität von Plasmidproben entwickelt. Solche Untersuchungen sind besonders wichtig für die Bewertung eines Plasmid-Produktionsprozesses und des erhaltenen Produktes.
Der Standard-Test beinhaltet die Analyse der Plasmid DNA durch Agarosegelelektrophorese (AGE, Abb. 1) und Kapillargelelektrophorese (CGE, Abb. 2) und die Bestimmung des Verhältnisses zwischen superspiralisierter (ccc) und offenkettiger (oc) Form. Die Verhältnisse werden durch densitometrische Auswertung (AGE) bzw. Bestimmung der normierten Peakflächen (CGE) ermittelt.
Diese Untersuchungen werden vom Lehrstuhl auch als Service-Dienstleistung durchgeführt.
Abb. 1: Agarosegelelektrophorese: Zwei unbehandelte Plasmidproben, eine Plasmidprobe, in oc-Form überführt.
Abb. 2: Elektropherogramm einer Plasmidprobe.
In besonderen Fällen kann auch eine erweiterte Analyse (Abb. 3) durchgeführt werden, in der vorhandene Plasmid-Multimere charakterisiert und quantifiziert werden.
Abb. 3: Elektropherogramm einer Plasmidprobe in der erweiterten Analyse.