veranstalter
Jens Reeder
art der veranstaltung
Seminar
sws
2
kommentar
In diesem Seminar sollen aktuelle Themen der Bioinformatik besprochen
werden. Die Auswahl der Themen wird sich an die aktuelle Forschung der
Arbeitsgruppe anlehnen.
Mögliche Themen sind :
- Suche nach nichtkodierender RNA in kompletten Genomen.
Im Gegensatz zu Protein kodierenden Genen haben RNA Gene keine
eindeutigen statistischen Eigenschaften die zur Klassifizierung benutzt
werden können. Das macht die Suche nach ihnen schwer. Wir werden uns
z.B. anschauen, mit welchen Methoden nach micro RNA Genen gesucht wird.
- Suffix Array Construction in linear time.
- Multiple Alignment Algorithmen für grosse genomische Datenmengen.
Unter anderem wollen wir das Tool Multi-LAGAN besprechen.
Dieses Seminar wird in Form eines Journal Clubs gehalten. Das heisst alle
Teilnehmer lesen bereits vor jeder Sitzung ein Paper. Fragen und Probleme
werden dann gemeinsam diskutiert. Jeweils einer der Studenten wird dann
die Leitung der Diskussion für eine Sitzung übernehmen.
vorkenntnisse
Kenntnisse der grundlegendenden Bioinformatik Algorithmen
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