Bioinformatic Journal Club


veranstalter
Jens Reeder

art der veranstaltung
Seminar

sws
2

kommentar
In diesem Seminar sollen aktuelle Themen der Bioinformatik besprochen werden. Die Auswahl der Themen wird sich an die aktuelle Forschung der Arbeitsgruppe anlehnen.
Mögliche Themen sind :
  • Suche nach nichtkodierender RNA in kompletten Genomen. Im Gegensatz zu Protein kodierenden Genen haben RNA Gene keine eindeutigen statistischen Eigenschaften die zur Klassifizierung benutzt werden können. Das macht die Suche nach ihnen schwer. Wir werden uns z.B. anschauen, mit welchen Methoden nach micro RNA Genen gesucht wird.
  • Suffix Array Construction in linear time.
  • Multiple Alignment Algorithmen für grosse genomische Datenmengen. Unter anderem wollen wir das Tool Multi-LAGAN besprechen.
Dieses Seminar wird in Form eines Journal Clubs gehalten. Das heisst alle Teilnehmer lesen bereits vor jeder Sitzung ein Paper. Fragen und Probleme werden dann gemeinsam diskutiert. Jeweils einer der Studenten wird dann die Leitung der Diskussion für eine Sitzung übernehmen.

vorkenntnisse
Kenntnisse der grundlegendenden Bioinformatik Algorithmen

 
Fri Dec 19 10:54:56 CET 2014