Parallele Algorithmen und Rechnerarchitekturen in der Bioinformatik 


veranstalter
Georg Sauthoff

art der veranstaltung
Seminar

sws
2

kommentar
Die Themen des Seminars lassen sich in mehrere Bereiche unterteilen:
  • Parallele Rechnerarchitekturen
  • Parallele Algorithmen: Grundlagen
  • Parallele Algorithmen: Anwendungen

Im Bereich Rechnerarchitekturen passen z.B. sehr gut folgende Themen:
  • Grundlegende Paradigmen: Message Passing, Shared-Memory, SIMD, ...
  • GPU-Computing
  • Job-Verteilungssysteme: Grids, Clouds ...
  • Transactional Memory
  • Cluster-Dateisysteme
  • ...

Algorithmen:
  • map-and-reduce
  • Parallelisierung von Standardalgorithmen und Datenstrukturen
  • Grenzen der Parallelisierung (Amdahl's Law ...)
  • Anwendung diverser APIs: OpenCL, OpenMP, MPI, POSIX Threads ...
  • ...


vorkenntnisse

literatur
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Fri Dec 19 10:54:56 CET 2014