Teaching in SoSe 2002


392011	Molekulare Bioinformatik	Hofest�dt, K�hler
Seminar	Di ab 14ct in C01-136
	In der Lehrveranstaltung wird ein allgemeiner �berblick �ber die molekulare Bioinformatik geschaffen (Datenbanken, Visualisierung, Sequenzanalyse). Verschiedene Methoden und Systeme der Bioinformatik werden anhand relevanter Literatur erarbeitet. Ein weiterer Schwerpunkt auf der Anwendung dieser Methoden, d.h. es werden vor allem Systeme vorgestellt die auch �ber das Internet verf�gbar sind, so dass auch praktische Erfahrungen mit diesen Methoden gemacht werden k�nnen.


392014	Datenbankintegration f�r Molekularbiologische Datenbanken	Hofest�dt, K�hler
Seminar	Di ab 14ct in C01-136
	Mehr als 400 Molekularbiologische Datenbanken sind weltweit verf�gbar. Sie enthalten Daten zu Stoffwechselwegen, Proteinstrukturen, DNA Sequenzen, Organismen, Krankheiten, etc. Sie sind somit die Grundlage f�r viele bioinformatische und molekularbiologische Fragestellungen, f�r deren Bearbeitung h�ufig ein Durchsuchen und Kombinieren verschiedener Datenbanken erforderlich ist. Im Rahmen der Lehrveranstaltung werden einerseits spezifische Probleme der Integration molekularbiologischer Datenbanken und andererseits erschiedene Systeme f�r die Integration molekularbiologischer Datenbanken behandelt. Es wird ein aktueller �berblick �ber die verschiedenen molekularbiologischen Datenbanken, die Integrationsm�glichkeiten und den Mehrwert durch die Integration geschaffen.


392111	Datenbanken II	Hofest�dt
Vorlesung	Do 12-14 Uhr	15.04.2002 - 19.07.2002
	Schwerpunkt der Vorlesung sind Konzepte der objektorientierten Datenbanken sowie die Integration von Dateisystemen und Datenbanken. Bez�glich der Datenbankintegration wird das Konzept der F�derierung genauer betrachtet


392112	�bungen zu Datenbanken II	Freier, Niemann
�bung	Do 12-14 Uhr in H1



392118	Biomedizinische Wissensverarbeitung	Hofest�dt
Vorlesung	Mo 12:00-14:00 Uhr in C01-142	15.04.2002 - 19.07.2002
	Eine Vielzahl von Krankheiten kann heute auf molekulare Defekte bis hin zur Punktmutation zur�ckgef�hrt werden. Die Verarbeitung dieser Daten im medizinischen Kontext ist eine aktuelle Aufgabe und steht in dieser Vorlesung zur Diskussion. Die Wissensverarbeitung spielt bei der Verarbeitung des unsicheren medizinischen Wissens eine herausragende Rolle. Kausal probabilistische Netze und Methoden aus dem Bereich Case Based Reasoning finden derzeit verst�rkt Anwendung.


392119	�bungen zu Biomedizinische Wissensverarbeitung	K�hler
�bung



392136	Simulation metabolischer Netzwerke	Hofest�dt
Seminar	Do 14-16 Uhr in C01-249
	Metabolische Netzwerke k�nnen nur �ber geeignete Simulationstools analysiert werden. Das Seminar diskutiert verschiedenen Ans�tze der Modellierung sowie die dazu verf�gbaren Simulatoren


392141	Mediabolics - Hypermedia f�r metabolische Prozesse	Lorenz, K�hler
Projekt-Seminar	Mo 14-16 Uhr in D5-113 Mi 14-18 Uhr in D5-113 (Plenum) Fr 10-12 Uhr in D5-113
	Das interdisziplinare Projektseminar orientiert sich im Hinblick auf Denkweise und Zielsetzung an realer industrieller Projektarbeit. Ziel ist es, die Seminar-TeilnehmerInnen mit heoretischen und vordergr�ndig praktischen Aspekten des Software-Engineering-Prozesses vertraut zu machen. Ausgehend von einem konkreten Kundenszenario werden s�mtliche konstruktiven Phasen und T�tigkeiten von der Vorstudie bis zur Auslieferung eines Produktes durchlaufen. Dabei sollen alle Aspekte eines realen Projekts behandelt werden, nicht nur der Entwurf und die Codierung von SW, sondern auch der Kontakt mit dem realen Kunden, die Erstellung eines Angebots, Brainstorming und Review, Aufwandsabsch�tzung und Planung, Literatursuche und Test, Spezifikation und Benutzerhandbuch, die Erhebung von Kennzahlen und nicht zuletzt der Umgang mit Risiken und Krisen, inkl. Projektleitung und Qualit�tssicherung. Hinzu kommt die eigentliche Projektdokumentation (d.h. der zeitliche Verlauf, die Aufzeichnungen der im Projekt erhobenen Daten). Dabei sind u.a. unternehmerisches Handeln, Konzeptarbeit, Teamarbeit und Pr�sentationstechnik gefragt. Das wichtigste SW-Resultat des Projekts ist ein webbasiertes Hypermedia-Informations- und Lehrsystem, welches im Anschluss an das Projekt einen fester Bestandteil in der universit�ren Bioinformatik-Ausbildung darstellt. Um vorhandene Ressourcen wie Tutorials und WebSeiten automatisch in das System einzubinden und auf diese in geeigneter Art und Weise zu verweisen, soll eine auf speziellen Datenstrukturen und Methoden der KI basierende semantische Suchmaschine konzipiert und implementiert werden. Das Seminar hat eine Laufzeit von 12 Monaten und ist auf 15 Teilnehmer beschr�nkt. Es richtet sich an Studierende im NWI-Hauptstudium und an Studierende des Bachelor-Studiengangs Mediengestaltung. Voraussetzungen: Voraussetzung ist die Bereitschaft, sich in eines oder mehrere der folgenden Themen einzuarbeiten: Mediengestaltung, Hypermedia-Produktion und -Projektmanagement, Content-Management-/DB-Systeme (SQL), Bioinformatik, JAVA, HTML/XML, Dynamische Generierung von Webseiten, Methoden der KI und sonstige sich aus der Projektarbeit ergebenden Techniken.


392149	Arbeitsgemeinschaft Bioinformatik/ Medizinische Informatik
AG	Mi in D5-113
	Ausgew�hlte Themen der Bioinformatik