Teaching in SoSe 2004


392119	Datenbanken I	Hofest�dt
Vorlesung	Zeit: Mo 14-16 Uhr; Raum: H10
	Beginn: 26. April Inhalte der Vorlesung: Relationen, Relationale Algebra, Konzeption einer Datenbank, ER-Modell, Realtionale Datenbanken, Architekturen von Datenbanken, Anfragesprachen, Architekturen verf�gbarer "Molekularer Datenbanken".


392120	�bungen zu 392011- Datenbanken I	Freier
�bung	1: Zeit: Mi 10-12 Uhr; Raum: D5-113; 2: Zeit: Mi 15-17 Uhr; Raum: V2-222; 3: Zeit: Do 12-14 Uhr; Raum: U2-147;
	�bung zu Veranstaltung 392119 (s. oben)


392121	Biomedizinische Informationssysteme	Hofest�dt
Vorlesung	Zeit: Di 14-16 Uhr; Raum: C01-226
	Beginn: 27. April Eine Vielzahl von Krankheiten kann heute auf molekulare Defekte bis hin zur Punktmutation zur�ckgef�hrt werden. Die integrative Verarbeitung dieser Daten im medizinischen Kontext ist eine aktuelle Aufgabe und steht in dieser Vorlesung zur Diskussion. Die Wissensverarbeitung spielt bei der Verarbeitung des unsicheren biomedizinischen Wissens eine herausragende Rolle. Kausal probabilistische Netze und Methoden aus dem Bereich Case Based Reasoning finden derzeit verst�rkt Anwendung.


392122	�bungen zu 392121 - Biomedizinische Informationssysteme	R�egg
Vorlesung	1. Termin: Do 16-18 Uhr; Raum: D5-113
	Beginn: 29. April �bung zu Veranstaltung 392121 (s. oben)


394001	Sequenzanalysepraktikum	Lorenz
Praktikum	Zeit: Do 10-12 Uhr; Raum: V2-221 (Rechnerpool)
	Zu den t�glichen Aufgaben der Molekularen Biologie und Bioinformatik geh�rt die Benutzung einer wachsenden Anzahl von Software-Werkzeugen, die das Internet zur Verf�gung stellt. Dazu geh�rt der Zugriff auf die gro�en Datenbanken (GenBank, EMBL, etc.), "Suche nach Homologen Sequenzen", "Vergleich von Sequenzfamilien" und "Bestimmung von Sekund�r- und Terti�rstrukturen". Anhand biologisch motivierter Aufgabenstellungen werden Erfahrungen im Umgang mit diesen Werkzeugen vermittelt. Die Veranstaltung richtet sich an Studierende im Hauptstudium NWI/Biotechnologie und Studierende des B. Sc. Bioinformatik und Genomforschung im vierten Semester. Interessenten tragen sich in die entsprechende Teilnehmerliste ein (Raum D5-116). Die �bung setzt Vorkenntnisse aus den Vorlesungen �Molekulare Genetik I und II" und �Grundlagen der Sequenzanalyse� voraus. Diese k�nnen auch parallel zur �bung, z.B. anhand des Skriptes �Grundlagen der Sequenzanalyse� von S. Kurtz erworben werden.


392016	Parallele Datenverarbeitung	Niemann
Seminar	Zeit: Di 14-16 Uhr Raum: D5-113
	In dem Seminar "Parallele Datenverarbeitung" werden theoretische sowie praktische Kenntnisse Im Bereich High Performance Computing vermittelt. Eine ausf�hrliche Themenliste findet man unter www.techfak.uni-bielefeld.de/~mniemann Die Vorbesprechung findet in der ersten Semesterwoche statt. (Siehe Aushang -- Ank�ndigung auf der Website) Weiterf�hrende Literatur: Joseph Ja Ja, An Introduction to Parallel Algorithms Addison-Wesley, 1992 Andrews, Foundations of Multithreaded, Parallel, and Distributed ProgrammingAddison-Wesley, 2000 Raber und R�nger, Parallele und verteilte Programmierung, Springer, 2000 Peter S. Pacheo, Parallel Programming with MPI, Morgan Kaufmann, 1997 Wenzel, Parallele Programmierkonzepte, Franzis, 1991 Tannenbaum, Verteilte Betriebssysteme, Prentice Hall, 1994 Vossen, Rechneraufbau und Rechnerstrukturen Oldenbourg, 1997 F. Thomas Leighton, Einf�hrung in Parallele Algorithmen und Architekturen, Thomson Publishing, 1997 John E. Hopcroft, Einf�hrung in die Automatentheorie, Formale Sprachen ubd Komplexit?�tstheorie, Addison-Wesley, 1997 Rajkumar Buyya, High Performance Cluster Computing, Prentice Hall, 1999


392153	Mediabolics III	Lorenz
Projekt	Zeit: Do 14-17 Uhr; Raum: D5-116
	Die Lehrveranstaltung l�uft seit dem WiSe 03/04. Es werden keine neuen Teilnehmer aufgenommen.


392130	Petrinetze in der biologischen Anwendung	Hofest�dt
Seminar	Zeit: Do 14-16 Uhr; Raum: D5-113
	Nebenl�ufige Prozesse lassen sich geeignet durch den von Adam Petri entwickelten Formalismus modellieren und simulieren. Im Seminar werden einfache Petrinetze definiert und spezifische Erweiterungen dieser Theorie bis hin zu aktuellen Simulatoren diskutiert.


392131	Integration biologischer Datenbanken	K�hler, Freier
Seminar	Zeit: Blockseminar, Termine nach Vereinbarung
	Mehr als 400 Molekularbiologische Datenbanken sind weltweit verf�gbar. Sie enthalten Daten zu Stoffwechselwegen, Proteinstrukturen, DNA Sequenzen, Organismen, Krankheiten, etc. Sie sind somit die Grundlage f�r viele bioinformatische und molekularbiologische Fragestellungen, f�r deren Bearbeitung h�ufig ein Durchsuchen und Kombinieren verschiedener Datenbanken erforderlich ist. Im Rahmen der Lehrveranstaltung werden einerseits spezifische Probleme der Integration molekularbiologischer Datenbanken und andererseits verschiedene Systeme f�r die Integration molekularbiologischer Datenbanken behandelt. Es wird ein aktueller �berblick �ber die verschiedenen molekularbiologischen Datenbanken, die Integrationsm�glichkeiten und den Mehrwert durch die Integration geschaffen.


392132	Biomedizinische Informationssysteme	Hofest�dt, Schneider
Seminar	Zeit: Di 14-16 Uhr; Raum: D5-113
	In diesem Seminar werden aktuelle Ans�tze im Bereich der Entwicklung und Implementierung von komplexen Laborinformationssystemen diskutiert.


392185 Seminar	Arbeitsgemeinschaft Bioinformatik Zeit: n.V. ; Ort: D5-113	Hofest�dt, Lorenz
	Ausgew�hlte Themen der Bioinformatik