Medizinische Bioinformatik
und Systembiologie




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Teaching in SoSe 2009


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  Medizinische Wissensverarbeitung    
Vorlesung   Zeit: Di, 14 - 16 Uhr; Raum: T2-204   Hofestädt
Übung   Zeit: Mi, 16 - 18 Uhr; Raum: D5-113   Kormeier
    Die medizinische Wissensverarbeitung ist ein wesentliches Gebiet der �Medizinischen Informatik�. Die molekulare Biologie in Kombination mit den Methoden der Bioinformatik hat auch dieses Gebiet in den vergangenen Jahren neu pr�gen k�nnen. Der diagnostische Einsatz der Methoden des fallbasierten Schlie�ens (Case Based Reasoning) sowie der kausal probabilistischen Netze werden in dieser Vorlesung zentral behandelt.

Es werden die Themen der Vorlesung anhand von theoretischen und praktischen �bungsaufgaben vertieft.

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Biomedizinische Informationssysteme    
Vorlesung   Zeit: Mo, 14 - 16 Uhr; Raum: C01-136   Hofestädt
Übung   Zeit: Mo, 16 - 18 Uhr; Raum: D5-113   Kormeier
    Eine Vielzahl von Krankheiten kann heute auf molekulare Defekte bis hin zur Punktmutation zur�ckgef�hrt werden. Die integrative Verarbeitung dieser Daten im medizinischen Kontext ist eine aktuelle Aufgabe und steht in dieser Vorlesung zur Diskussion. Die Wissensverarbeitung spielt bei der Verarbeitung des unsicheren biomedizinischen Wissens eine herausragende Rolle. Kausal probabilistische Netze und Methoden aus dem Bereich Case-Based Reasoning finden derzeit verst�rkt Anwendung.

Es werden die Themen der Vorlesung anhand von theoretischen und praktischen �bungsaufgaben vertieft.

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392121   Seminar Zellulare Automaten - Anwendungen und Theorie   Hofestädt
Seminar   Zeit: n.V. (siehe Aushang); Raum: D5-113  
    Im Seminar wird grundlegende und weiterführende Literatur zum Thema "Zellulare Automaten" behandelt. Zu den entsprechenden Themen werden durch die Teilnehmer Vorträge gehalten.

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392139   Seminar Petri-Netze in der Anwendung   Hofestädt
Seminar   Zeit: n.V. (siehe Aushang); Raum: D5-113  
    Im Seminar wird grundlegende und weiterführende Literatur zum Thema "Petri-Netze" behandelt. Zu den entsprechenden Themen werden durch die Teilnehmer Vorträge gehalten.

    Weitere Informationen
392147   Integration und Analyse biologischer Netzwerke   Kormeier, Töpel
Projekt   Zeit: M0, 16 - 18 Uhr; Raum: D5-113  
   

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392141   Parallele Algorithmen in der Bioinformatik   Braun
Seminar   Zeit: n.V.; Raum: D5-113    
   

Vorbesprechung: Mi., 22.04.2009; 16.00 Uhr s.t.; D5-113

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392157   Message Passing Programming   Braun
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: D5-113    
   

Vorbesprechung: Do., 23.04.2009; 16.00 Uhr s.t.; D5-113

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Projekt
  CELLmicrocosmos - CellExplorer
Zeit: Vorbesprechung: Mi, 22.04.2009, 14:00 Uhr c.t.; Raum: C5-151
  Hofestädt, Sommer
   

Back to the roots! Es ist schon einige Zeit her, als das interdisziplinäre CELLmicrocosmos-Projekt mit der Idee begann, eine virtuelle Zellumgebung zu schaffen. Zu diesem Grundgedanken werden wir in diesem Projekt zur�ckkehren und dabei von den Ergebnissen der Vorgängerprojekte profitieren.

Während sich diese zu gro�en Teilen mit der Datenakquise beschäftigt haben, wird es in diesem Projekt darum gehen, diese Daten in ansprechender Form zu präsentieren und zu explorieren.

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392151   Projekt Bioinformatik   Giegerich, Hofestädt, Stoye
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: n.V.  
   

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Seminar
  Arbeitsgemeinschaft Bioinformatik
Zeit: Do, 11 Uhr ; Raum: D5-113
  Hofestädt
    Ausgewählte Themen der Bioinformatik

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