Medizinische Bioinformatik
und Systembiologie




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Teaching in SoSe 2015


392187
Seminar
  AG Seminar Bioinformatik / Medizinische Informatik
Zeit: Do, 11 - 13 Uhr ; Raum: D5-113
  Hofestädt
    Ausgewählte Themen der Bioinformatik

   
392145 Biopharmazeutische Informationssysteme    
Vorlesung   Zeit: Mo, 12 - 14 Uhr; Raum: D5-113;   Hofestädt
392120      
Übung   Zeit: n. V.; Raum: D5-113   Brinkrolf
    Zunächst erfolgt die Definition und Diskussion des klassischen Begriffs der Informationsverarbeitung und der Informationssysteme. Außerdem werden grundlegende Bemerkungen zu Ontologien und Datenaustauschformaten gemacht, sowie relevante Beispiele aus der Praxis vorgestellt. Im Anschluß erfolgt eine Einführung in die typischen Datenquellen im Bereich der molekularen Medizin. Auf der Grundlage unterschiedlicher Integrationsansätze werden existierende Werkzeuge zur Integration heterogener Datenquellen diskutiert. Abschließend wird eine Einführung in die grundlegenden Techniken zur Entwicklung web-basierter Informationssysteme gegeben.

Mit theoretischen und praktischen Übungen werden die Themen der Vorlesung vertieft.

   
392147   Fehleranalyse bei molekularen Datenbanken   Hofestädt
Seminar   Zeit: n. V., Raum: D5-113  
   

1. Vorbesprechung: Di, 14.04.2015, 11.30 Uhr, Raum D5-113

2. Vorbesprechung: Di, 21.04.2015, 11.30 Uhr, Raum D5-113

   
392148   Einf�hrung und Anwendung der Petri-Netze   Hofestädt
Seminar   Zeit: n. V., Raum: D5-113  
   

1. Vorbesprechung: Di, 14.04.2015, 11 Uhr, Raum D5-113

2. Vorbesprechung: Di, 21.04.2015, 11 Uhr, Raum D5-113

   
392105   Medizinische Wissensverarbeitung    
Vorlesung   Zeit: Di, 14 - 16 Uhr; Raum: X-E0-216   Hofestädt
392106        
Übung   Zeit: Di, 12 - 14 Uhr, Raum D5-113   Lewinski
    Die medizinische Wissensverarbeitung ist ein wesentliches Gebiet der �Medizinischen Informatik�. Die molekulare Biologie in Kombination mit den Methoden der Bioinformatik hat auch dieses Gebiet in den vergangenen Jahren neu pr�gen k�nnen. Der diagnostische Einsatz der Methoden des fallbasierten Schlie�ens (Case Based Reasoning) sowie der kausal probabilistischen Netze werden in dieser Vorlesung zentral behandelt.

Es werden die Themen der Vorlesung anhand von theoretischen und praktischen �bungsaufgaben vertieft.

   
392150   Konzeption und Implementierung biomedizinischer Informationssysteme   Ogultarhan
Projektseminar   Zeit: n. V.; Raum: D5-113  
   

1. Vorbesprechung: Mi, 08.04.2015, 14 Uhr, Raum: D5-113
2. Vorbesprechung: Di, 14.04.2015, 16 Uhr, Raum: D5-113

   
392250   Analyse und Visualisierung biologischer Netzwerke   Kormeier
Projekt (Master)   Zeit: Do, 16 - 18 Uhr; Raum: D5-113  
   

Vorbesprechung: Do, 09.04.2015, 16 Uhr c.t.; D5-113

   
392251   Entwicklung eines web-basierten Informationssystems f�r molekularbiologische Daten   Kormeier
Projekt   Zeit: Mi, 16 - 18 Uhr; Raum: D5-113  
   

1. Vorbesprechung: Mi, 08.04.2015, 16 Uhr c.t.; D5-113
2. Vorbesprechung: Mi, 15.04.2015, 16 Uhr c.t.; D5-113

   
392171   Parallele Algorithmen und Datenverarbeitung   Lewinski
Projekt   Zeit: n.V. ; Raum: D5-117    
   

Keine Vorbesprechung: Mail an mlewinsk[at]techfak.uni-bielefeld.de für Termin.

Dieses 3LP Projekt ist Teil des Moduls: 39-M-Inf-PDV Parallele Datenverarbeitung.

   
392232   Multidimensional Cell Visualization   Kormeier
Seminar   Zeit: Mi, ab 10.15 Uhr; Raum: D5-113 oder C5-151  
   

In allen Biologie-verwandten Studienf�chern begegnen uns die unterschiedlichsten Visualisierungsans�tze von Zellen: Angefangen von Buch-Illustrationen �ber Filme/Animationen, verschiedenste Arten der Mikroskopie, Lernsoftware und Membransimulationen. In diesem Seminar soll im Rahmen von Referaten ein �berblick und ein erstes Bewertungskonzept zu diesem weitl�ufigen Thema erarbeitet werden.

1. Vorbesprechung: Mi, 08.04.2015, 10 Uhr c.t.; D5-113
2. Vorbesprechung: Mi, 15.04.2015, 10 Uhr c.t.; D5-113

    Weitere Informationen
392110   Interdisciplinary Cell Visualization and Modeling   Kormeier
Vorlesung   Zeit: Fr, 10.15 - 12.15 Uhr; Raum: D5-113 oder C5-151  
   

In der Vorlesung werden die unterschiedlichsten ZellVisualisierungsansätze besprochen und analysiert. Gleichzeitig wird Basiswissen im Bereich der Zellbiologie vermittelt werden. Das interdisziplinäre Spektrum reicht von Filmsequenzen �ber Buch-Illustrationen, Webseiten, Datenbanken, Edukativen Ans�tzen, Computerspielen und -programmen. In Relation dazu werden zelluläre Simulationsansätze, wissenschaftliche Publikationen und die durch die Mikroskopie generierte Realität gesetzt. Nicht zuletzt wird dabei auch auf die umfangreichen Resultate aus den letzten CELLmicrocosmos-Projekten und -Abschlussarbeiten zur�ckgegriffen werden k�nnen.

    Weitere Informationen