Medizinische Bioinformatik
und Systembiologie




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Teaching in SoSe 2023


392145 Biomedizinische Informationssysteme    
Vorlesung   Zeit: Mo, 12 - 14 Uhr; D5-113   Hofestädt
392114      
Übung   Zeit: Mi, 12 - 14 Uhr; C5-148 / 150   Friedrichs
    Zunächst erfolgt die Definition und Diskussion des klassischen Begriffs der Informationsverarbeitung und der Informationssysteme. Außerdem werden grundlegende Bemerkungen zu Ontologien und Datenaustauschformaten gemacht, sowie relevante Beispiele aus der Praxis vorgestellt. Im Anschluß erfolgt eine Einführung in die typischen Datenquellen im Bereich der molekularen Medizin. Auf der Grundlage unterschiedlicher Integrationsansätze werden existierende Werkzeuge zur Integration heterogener Datenquellen diskutiert. Abschließend wird eine Einführung in die grundlegenden Techniken zur Entwicklung web-basierter Informationssysteme gegeben.

Mit theoretischen und praktischen Übungen werden die Themen der Vorlesung vertieft.

     
392147   Fehleranalyse bei molekularen Datenbanken   Hofestädt
Seminar   Zeit: Block n. V.; D5-113

 
   

1. Vorbesprechung: Mi, 12.04.2023, 13 Uhr s.t.; D5-113

2. Vorbesprechung: Mi, 19.04.2023, 13 Uhr s.t.; D5-113

   
392148   Einführung und Anwendung der Petri-Netze   Hofestädt
Seminar   Zeit: Block n. V.; D5-113

 
   

1. Vorbesprechung: Mi, 12.04.2023, 14 Uhr s.t.; D5-113

2. Vorbesprechung: Mi, 19.04.2023, 14 Uhr s.t.; D5-113

   
392107   Medizinische Wissensverarbeitung    
Vorlesung   Zeit: Di, 14 - 16 Uhr;   Hofestädt
392108        
Übung   Zeit: Mo, 10 - 12 Uhr;   Königs
    Die medizinische Wissensverarbeitung ist ein wesentliches Gebiet der "Medizinischen Informatik". Die molekulare Biologie in Kombination mit den Methoden der Bioinformatik hat auch dieses Gebiet in den vergangenen Jahren neu prägen können. Der diagnostische Einsatz der Methoden des fallbasierten Schließens (Case Based Reasoning) sowie der kausal probabilistischen Netze werden in dieser Vorlesung zentral behandelt.

Es werden die Themen der Vorlesung anhand von theoretischen und praktischen Übungsaufgaben vertieft.

     
392150   Konzeption und Implementierung biomedizinischer Informationssysteme   Friedrichs, Königs
Projektseminar      
   

Es finden keine Vorbesprechungstermine statt! Mögliche Themen werden im entsprechenden Lernraum zur Verfügung gestellt (i.d.R. innerhalb der ersten zwei Vorlesungswochen). Bei Interesse melden Sie sich bitte bei den Modulverantwortlichen.

     
392238   Analyse und Visualisierung biologischer Netzwerke   Königs, Friedrichs
Projekt (Master)      
   

Es finden keine Vorbesprechungstermine statt! Mögliche Themen werden im entsprechenden Lernraum zur Verfügung gestellt (i.d.R. innerhalb der ersten zwei Vorlesungswochen). Bei Interesse melden Sie sich bitte bei den Modulverantwortlichen.