Medizinische Bioinformatik
und Systembiologie




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Teaching in WiSe 2009/10


392146   Modellierung und Simulation metabolischer Netzwerke    
Vorlesung   Zeit: Mo, 14 - 16 Uhr; Raum: C01-136   Hofestädt
Übung   Zeit: n.V.; Raum: D5-113   Kormeier
    Die Vorlesung gibt einen Überblick über die existierenden Modellansätze zur Modellierung metabolischer Netzwerke. Insbesondere wird die regelbasierte Modellierung sowie die Modellierung mit Petrinetzen vorgestellt. Anschlie?end erfolgt eine Überblick über die verfügbaren Datenquellen im Internet sowie die verfügbaren Simulatoren.

In dieser Übung werden verschiedene Themen aus der Vorlesung vertieft behandelt und praktisch nachvollzogen. Schwerpunkte der Übung sind: Design molekularer Datenbanken, dynamische Modellierung von Pathways und Datenvisualisierung.

    Weitere Informationen
392144 Parallele Algorithmen    
Vorlesung   Zeit: Do, 14 - 16 Uhr; Raum: C01-136   Hofestädt
Übung   Zeit: n.V.; Raum: D5-113 / C5-153   Braun
    Ausgangspunkt ist die Definition paralleler Algorithmen. Grundlegende theoretische Modelle der parallelen Datenverarbeitung werden vorgestellt (z.B. Schaltkreise, P-RAM). Der Entwurf paralleler Algorithmen wird diskutiert. Grundkonzepte parallele Architekturen werden vorgestellt.

Parallele Algorithmen auf der Grundlage des "message passing" Konzeptes werden in der Übung am verfügbaren Parallelrechner implementiert und getestet.

    Weitere Informationen
392149   Fehleranalyse für molekulare Datenbanken    
Seminar   Zeit: n.V.; Raum: D5-113   Hofestädt
    Vorbesprechung: Mi, 14.10.2009 11 Uhr s.t.; Raum D5-113
2. Vorbesprechung: Mi, 21.10.2009 11 Uhr s.t.; Raum D5-113

  Weitere Informationen
392148   Petri-Netze in der Bioinformatik   Hofestädt
Seminar   Zeit: n.V.; Raum: D5-113  
    Vorbesprechung: Mi, 14.10.2009 12 Uhr s.t.; Raum D5-113
2. Vorbesprechung: Mi, 21.10.2009 12 Uhr s.t.; Raum D5-113

Im Seminar wird grundlegende und weiterführende Literatur zum Thema "Petri-Netze" behandelt. Zu den entsprechenden Themen werden durch die Teilnehmer Vorträge gehalten.

    Weitere Informationen
392150   Data Warehousing in der Bioinformatik: Methoden und Systeme   Kormeier
Seminar   Zeit: n.V. (siehe Aushang); Raum: D5-113  
    Vorbesprechung: Mi, 21.10.2009 14 Uhr s.t.; Raum D5-113

Im Seminar wird grundlegende und weiterführende Literatur zum Thema "Data Warehouses" behandelt. Zu den entsprechenden Themen werden durch die Teilnehmer Vorträge gehalten.

    Weitere Informationen
392172   Analyse und Visualisierung biologischer Netzwerke   Kormeier
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: D5-113  
    Vorbesprechung: Mi, 21.10.2009 16 Uhr s.t.; Raum D5-113

    Weitere Informationen
392171   Message Passing Programming   Braun
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: D5-113, C5-153  
   

    Weitere Informationen
209818   Forschungsmodul (prakt.): Genom- und Postgenomforschung an ausgew. Beispielen   Anselmetti, Dierks, Dietz, Eichenlaub, Flaschel, Giegerich, Hofest´┐Żdt, Niehaus, Noll, Schmid, Sewald, Staiger, Stoye, Weisshaar, Kruse, Patschkowski, Kaltschmidt, Kaltschmidt, Lutter, Tauch
Seminar
Projekt
 

    Weitere Informationen
392151   Projekt Bioinformatik   Giegerich, Hofestädt, Stoye
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: n.V.  
   

    Weitere Informationen
392187
Seminar
  AG Seminar Bioinformatik / Medizinische Informatik
Zeit: Do, 11 Uhr ; Raum: D5-113
  Hofestädt
    Ausgewählte Themen der Bioinformatik

    Weitere Informationen