Teaching in WiSe 2015/16
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| 392145 | Modellierung und Simulation metabolischer Netzwerke | |||
| Vorlesung | Zeit: Mo., 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113 | Hofestädt | ||
| Übung | Zeit: n.V.; Raum: D5-113 | Brinkrolf | ||
| Die Vorlesung gibt einen Überblick über die existierenden Modellansätze zur Modellierung metabolischer Netzwerke. Insbesondere wird die regelbasierte Modellierung sowie die Modellierung mit Petri-Netzen vorgestellt. Anschließend erfolgt ein Überblick über die verfügbaren Datenquellen im Internet sowie die verfügbaren Simulatoren. In dieser Übung werden verschiedene Themen aus der Vorlesung vertieft behandelt und praktisch nachvollzogen. Schwerpunkte der Übung sind: Design molekularer Datenbanken, dynamische Modellierung von Pathways und Datenvisualisierung. | ||||
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| 392144 | Parallele Algorithmen und Datenverarbeitung | |||
| Vorlesung | Zeit: Do., 14 - 16 Uhr; Raum: U0-139 | Hofestädt | ||
| Übung | Zeit: Mo. & Do., 12 - 14 Uhr, Raum: V2-222 | Lewinski | ||
| Ausgangspunkt ist die Definition paralleler Algorithmen. Grundlegende theoretische Modelle der parallelen Datenverarbeitung werden vorgestellt (z.B. Schaltkreise, P-RAM). Der Entwurf paralleler Algorithmen wird diskutiert. Grundkonzepte parallele Architekturen werden vorgestellt. Parallele Algorithmen auf der Grundlage des "message passing" Konzeptes werden in der Übung am verfügbaren Parallelrechner implementiert und getestet. | ||||
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| 392148 | Einführung und Anwendung der Petri-Netze | Hofestädt | ||
| Seminar | Zeit: Di., 11 s.t.; Raum: D5-113 | |||
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Im Seminar wird grundlegende und weiterführende Literatur zum Thema "Petri-Netze" behandelt. Zu den entsprechenden Themen werden durch die Teilnehmer Vorträge gehalten. Vorbesprechung: Mi., 21.10.2015, 12.00 Uhr s.t.; Raum: D5-113 | ||||
| Weitere Informationen | ||||
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| 392171 | Projekt: Parallele Algorithmen | Lewinski | ||
| Projekt | Zeit: n.V.; Raum: D5-113 | |||
Vorbesprechung: n. V.; Raum: D5-113 | ||||
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| 392178 | Projekt: Parallele Algorithmen biologischer Netzwerke | Lewinski | ||
| Projekt | Zeit: n.V.; Raum: D5-113 | |||
Vorbesprechung: n.V.; Raum: D5-113 | ||||
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| 392250 | Analyse und Visualisierung biologischer Netzwerke | Kormeier | ||
| Projekt | Zeit: Do., 16-18 Uhr; Raum: D5-113 | |||
| Vorbesprechung: Do., 22.10.2015, 16 Uhr s.t.; Raum D5-113 | ||||
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| 392251 | Entwicklung eines web-basierten Informationssystems für molekularbiologische Daten | Kormeier | ||
| Projekt | Zeit: Mi., 16-18 Uhr; Raum: D5-113 | |||
| Vorbesprechung: Mi., 21.10.2015, 16 Uhr s.t.; Raum D5-113 | ||||
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| 392155 | Konzeption und Implementierung biomedizinischer Informationssysteme | Hofestädt, Shoshi, Ogultarhan | ||
| Projekt | Zeit: Mi., 14-16 Uhr; Raum: D5-113 | |||
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Vorbesprechung: Mi., 21.10.2015, 14 Uhr c.t.; Raum D5-113 | ||||
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| 392179 | CELLmicrocosmos Cell Visualization | Kormeier | ||
| Projekt | Zeit: Fr., 10-12 Uhr; Raum: C5-151 | |||
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In den letzten Semestern wurden mehrere 3D-stereoskopische Szenarien mit Blender entworfen, die den Blick aus einem Fenster in die Natur möglichst realistisch nachbilden sollen. Diese werden nun als Ausgangspunkt für eine Reise vom "Real Life" zur molekularen Ebene benutzt werden, bei denen neben Blender auch CELLmicrocosmos-Tools zum Einsatz kommen werden. Vorbesprechung: Fr., 23.10.2015, 10.00 s.t., Raum: C5-151 | ||||
| Weitere Informationen | ||||
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| 392223 | AG Seminar Bioinformatik / Medizinische Informatik | Hofestädt | ||
| Seminar | Zeit: Do., 11 - 13 Uhr ; Raum: D5-113 | |||
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Ausgewählte Themen der Bioinformatik | ||||
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