Medizinische Bioinformatik
und Systembiologie




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Teaching in WiSe 2016/17


392145   Modellierung und Simulation metabolischer Netzwerke    
Vorlesung   Zeit: Mo., 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113   Hofestädt
392147      
Übung   Zeit: Mo., 16 - 18 Uhr; Raum: C5-150   Brinkrolf
    Die Vorlesung gibt einen Überblick über die existierenden Modellansätze zur Modellierung metabolischer Netzwerke. Insbesondere wird die regelbasierte Modellierung sowie die Modellierung mit Petri-Netzen vorgestellt. Anschließend erfolgt ein Überblick über die verfügbaren Datenquellen im Internet sowie die verfügbaren Simulatoren.

In dieser Übung werden verschiedene Themen aus der Vorlesung vertieft behandelt und praktisch nachvollzogen. Schwerpunkte der Übung sind: Design molekularer Datenbanken, dynamische Modellierung von Pathways und Datenvisualisierung.

   
392144 Parallele Algorithmen und Datenverarbeitung    
Vorlesung   Zeit: Do., 14 - 16 Uhr; Raum: X-E0-209   Hofestädt
392146      
Übung   Zeit: Mi. & Do. 16 - 18 Uhr; Raum: C5-150   Shoshi
    Ausgangspunkt ist die Definition paralleler Algorithmen. Grundlegende theoretische Modelle der parallelen Datenverarbeitung werden vorgestellt (z.B. Schaltkreise, P-RAM). Der Entwurf paralleler Algorithmen wird diskutiert. Grundkonzepte parallele Architekturen werden vorgestellt.

Parallele Algorithmen auf der Grundlage des "message passing" Konzeptes werden in der Übung am verfügbaren Parallelrechner implementiert und getestet.

   
392148   Einführung und Anwendung der Petri-Netze   Shoshi, Brinkrolf
Seminar   Zeit: n.V.; Raum: D5-113  
   

Im Seminar wird grundlegende und weiterführende Literatur zum Thema "Petri-Netze" behandelt.

1. Vorbesprechung: Mi., 19.10.2016, 12 Uhr s.t.; Raum: D5-113
2. Vorbesprechung: Mi., 26.10.2016, 12 Uhr s.t.; Raum: D5-113

   
392254   Höhere Petri-Netze und Nebenläufigkeit   Hofestädt
Seminar   Zeit: n.V.; Raum: D5-113  
   

Im Seminar wird grundlegende und weiterführende Literatur zum Thema "Höhere Petri-Netze und Nebenläufigkeit" behandelt. Zu den entsprechenden Themen werden durch die Teilnehmer Vorträge gehalten.

1. Vorbesprechung: Di., 25.10.2016, 12 Uhr s.t.; Raum: D5-113
2. Vorbesprechung: Di., 08.11.2016, 12 Uhr s.t.; Raum: D5-113

   
392149   Modelle und Architekturen der Parallelen Datenverarbeitung   Hofestädt
Seminar   Zeit: n.V.; Raum: D5-113  
   

1. Vorbesprechung: Di., 25.10.2016, 12.30 Uhr s.t.; Raum: D5-113
2. Vorbesprechung: Di., 08.11.2016, 12.30 Uhr s.t.; Raum: D5-113

   
392250   Analyse und Visualisierung biologischer Netzwerke   Shoshi, Brinkrolf
Projekt   Zeit: Do., 16 - 18 Uhr; Raum: D5-113  
   

Vorbesprechung: Do., 20.10.2016, 16 Uhr s.t.; Raum D5-113

   
392155   Konzeption und Implementierung biomedizinischer Informationssysteme   Shoshi, Brinkrolf
Projekt   Zeit: Di., 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113  
   

Vorbesprechung: Mi., 19.10.2016, 14 Uhr s.t.; Raum D5-113

   
392223   AG Seminar Bioinformatik / Medizinische Informatik   Hofestädt
Seminar   Zeit: Do., 11 - 13 Uhr; Raum: D5-113  
   

Ausgewählte Themen der Bioinformatik

   
398003   Master - Modularisierter Individueller Kompetenzerwerb   Büntemeyer, Hofestädt, Hammer, Cimiano, Kopp
MDP   Zeit: Mo.