Medizinische Bioinformatik
und Systembiologie




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Teaching in WiSe 2020/21


392145 Modellierung und Simulation metabolischer Netzwerke
Vorlesung Zeit: Mo., 14 - 16 Uhr; Online Hofestädt
392147
Übung Zeit: Fr., 14 - 16 Uhr; Online Königs
Die Vorlesung gibt einen Überblick über die existierenden Modellansätze zur Modellierung metabolischer Netzwerke. Insbesondere wird die regelbasierte Modellierung sowie die Modellierung mit Petri-Netzen vorgestellt. Anschließend erfolgt ein Überblick über die verfügbaren Datenquellen im Internet sowie die verfügbaren Simulatoren.

In dieser Übung werden verschiedene Themen aus der Vorlesung vertieft behandelt und praktisch nachvollzogen. Schwerpunkte der Übung sind: Design molekularer Datenbanken, dynamische Modellierung von Pathways und Datenvisualisierung.

392144 Parallele Algorithmen und Datenverarbeitung
Vorlesung Zeit: Do., 12 - 14 Uhr; Online Hofestädt
392146
Übung Zeit: Mi., 16 - 18 Uhr; Online Friedrichs
Ausgangspunkt ist die Definition paralleler Algorithmen. Grundlegende theoretische Modelle der parallelen Datenverarbeitung werden vorgestellt (z.B. Schaltkreise, P-RAM). Der Entwurf paralleler Algorithmen wird diskutiert. Grundkonzepte parallele Architekturen werden vorgestellt.

Parallele Algorithmen auf der Grundlage des "message passing" Konzeptes werden in der Übung am verfügbaren Parallelrechner implementiert und getestet.

392254 Höhere Petri-Netze und Nebenläufigkeit Hofestädt
Seminar Zeit: n.V.; Online

Im Seminar wird grundlegende und weiterführende Literatur zum Thema "Höhere Petri-Netze und Nebenläufigkeit" behandelt. Zu den entsprechenden Themen werden durch die Teilnehmer Vorträge gehalten.

1. Vorbesprechung: Mi., 28.10.2020, 11 Uhr s.t.; Online
2. Vorbesprechung: Di., 03.11.2020, 11 Uhr s.t.; Online

392149 Modelle und Architekturen der Parallelen Datenverarbeitung Hofestädt
Seminar Zeit: n.V.; Online

1. Vorbesprechung: Mi., 28.10.2020, 12 Uhr s.t.; Online
2. Vorbesprechung: Di., 03.11.2020, 12 Uhr s.t.; Online

392223 AG Seminar Bioinformatik / Medizinische Informatik Hofestädt
Seminar Zeit: Do., 11 - 13 Uhr; Online

Ausgewählte Themen der Bioinformatik

392250 Analyse und Visualisierung biologischer Netzwerke Königs
Projekt Zeit: n.V.; Online

392155 Konzeption und Implementierung biomedizinischer Informationssysteme Friedrichs
Projekt Zeit: n.V.; Online

398003 Master - Modularisierter Individueller Kompetenzerwerb Büntemeyer, Hofestädt, Hammer, Kopp, Wrede
MDP Zeit: N.N.